天生脸部畸形的奥吉，在家自学至10岁，终于进入了父母为他精心挑选的小学上了五年级。聪明的他没有被任何学习科目难倒，但样貌成了同学间绕不开的话题。五年级毕业时校长给他颁发了学校最高荣誉的奖章，全校师生和家长都激动地为他鼓掌，领奖时奥吉甚至想不明白为什么自己会得到奖章，“我只是和其他学生一样，度过了五年级而已”，但同时他也明白其实自己并没有那么普通，而且，没有人是普通的。
虽然片名叫做《奇迹男孩》，但影片并非仅仅围绕奥吉一人，同时还以他的好朋友杰克、姐姐维娅、姐姐的闺蜜米兰达等人的视角去展开了这个故事，亲情和友情贯穿始终，每一个人都在无形中促成奥吉创造了这个属于他的奇迹。
消除偏见这个主题，很容易就被拍成鸡汤电影了，但这部影片却总在细枝末节处带给人感动。懂事的姐姐偶尔也会因为弟弟占用了妈妈的精力而生闷气；杰克在维护和帮助奥吉的同时也说过言不由衷的话伤害了他；米兰达为曾经的虚荣感到后悔于是努力挽回友谊；之前歧视过奥吉的男孩儿在危急时刻挺身而出为他打架。真正可爱的孩子并非不会犯错，道歉之后依然能够保有最初的善良才更加可爱。
影片导演斯蒂芬·卓博斯基的上一部作品《壁花少年》也是着眼于青春期少男少女的故事，同样是一开始有些羞涩而敏感的主角，不同的是这部影片从情节到背景音乐，都毫无狂放不羁的影子，也丝毫不压抑（当然这个故事讲得好，很大程度上也得益于原著小说作者敏锐的洞察力）。整部片子都是一个温暖的气氛，节奏舒缓，娓娓道来。情节偏向平静，甚至有些过于平常，不扭捏、不煽情，不放大悲伤，也不隐瞒悲伤。每个人物刻画的都非常细腻，片中很多看似微小的细节处理都使得每个故事更加丰富和真实，也不露声色地让我们接受一个道理：没有人是完美的，不是只有自己才需要面对生活中残酷的难题，每个人都在与人生苦战，在包容他人的同时，我们更应该懂得接纳自己。
【校长图始曼】
这部影片中，校长的戏份少之又少，但每次出场都十分重要。智慧温和的大胡子校长，第一次见面就将好几个跟自己名字有关的外号对奥吉和盘托出，并让他“想笑就笑”。
在处理杰克跟朱利安打架的事情时，他并没有严肃地批评杰克，反而表态“友情是值得捍卫的”，并希望杰克能继续保持这种善良的本性。
但当校长发现朱利安屡次三番画图羞辱奥吉时，他叫来了朱利安的家长，表示“霸凌是很严重的行为”，要停课两天。其实那时候朱利安已经意识到了自己的错误，也很明确地讲了不想离开这个班级，但可悲的是，他那对“为学校捐了很多钱”的父母觉得自己的孩子才是最大的受害者，坚持转学了。转学后的朱利安能否不再“受委屈”我不得而知，但很替他担忧，这样一对父母，很可能会使他在成长的过程中逐渐丢掉本可以建立好的是非观。
“奥吉无法改变他的外貌，但我们可以改变看待他的眼光。”校长始终坚持这个观点，这正是奥吉父母努力要实现的目标。比起学习成绩和调皮捣蛋，图始曼校长更在意尊重和培养孩子们内心的善良。“如果一定要在正确和善良中做选择，请选择善良”，这是那位班主任老师分享的一句箴言，校长的所作所为很好地诠释了这句话——在处理每一件事情的时候，校长可以有很多“正确”的决定，但他每次都选择了最为善良的那一种。
【好朋友杰克】
孩子最为天真，可小孩子不会像大人一样伪装自己，所以奥吉每次从其他小孩儿的眼神中得到的反馈总是令人沮丧的——即便他可能已经习以为常了，但残忍的是，他自己也只是个孩子啊。
当杰克被告知要在暑假和两个他并不喜欢的同学一起带新生参观学校时，他是拒绝的，但当妈妈告诉他那位新生就是之前在冰淇淋店见过的那个孩子时，他同意了。杰克也承认刚开始确实只是因为妈妈让自己对奥吉好点，后来当他真正和奥吉接触后，他发现了奥吉的幽默，也从心底里佩服奥吉的聪明，他很开心两个人能成为最好的朋友，也可以不顾他人眼光在食堂坚定地坐在奥吉对面，他很善良，也很勇敢。很多时候对于一个孩子来说，“接纳歧视”这件事本身就会引起一场歧视。
